Od dłuższego czasu pracuję z następującymi narzędziami: Maven, Eclipse, Jetty. Nigdy nie starałem się na to by moje projekty dobrze współgrały z Eclipse ponieważ wszystko i tak uruchamiam przez Mavena. Korzyścią jest przenośność tego rozwiązania, wadą brak klikalnej wygody, tj zakładki serwerów w Eclipse i aplikacji które są na nich uruchomione.